先日、PDB ファイルから読んだタンパク質座標データを元に、コンタクトマップを numpy でミリ秒オーダーで計算する方法を書きました。 PDB ファイルを読み込みコンタクトマップをミリ秒で計算する - luggage baggage コンタクトマップとは、3次元空間内に存…